西元2199年,来自太阳系外的敌人加米()拉斯帝国,为了挽救母星的危亡,开始侵略其他星球。地球军在与加米拉斯帝国军的交战中惨败,同时加米拉斯帝国军向地球发射大量含有放射能的游星炸弹。地球的()抵抗力量越来()越弱。本与加米()拉斯为双子星球的伊()斯坎()达尔星球仗义相助,向地球发送了波动引擎和波动炮的设计图纸,并告知地球军本星球拥有清除放射能的设备“宇宙清洗器D”。在与欧洲、美洲失去联系的情况下,地球防卫军利用伊斯()坎达尔星球提()供的技术将沉睡于()海底的大()和()号改造为宇宙战舰。大和号()全体乘员踏上了取回“宇宙清洗器D”的漫漫征程。